Анатомія ще завдяки працям Везалия і Гарвея отримала міцну наукову основу. Ці вчені принципово правильно сформулювали будова людини, але багато чого ще було неясно і в наступні роки в анатомію вносилися доповнення та уточнення. Так, наприклад, Азеллі в 1622 р. відкрив лімфатичні судини, випадково пошкодивши «нерв» брижі живої собаки. Пеке (1622-1674), ще будучи студентом, Горн (1621-1670) описали вдруге грудної проток, відкритий Євстахієм. Анатомія почала розвиватися і в Англії, особливо після відкриття кровообігу Гарвея.

У Франції великим анатомом був Ріолан (1577-1657). Він вивчав будову мозку і став засновником першого анатомічного театру в Парижі. Дю Берні (1648-1740) досліджував орган слуху. Вьессен (1785), який розкрив більше 500 трупів, описав деякі деталі серцево-судинної і нервової систем. Данець Стенон (1638-1686), будучи студентом, відкрив протоку привушної залози, описав багато м'язи. Італієць Морганьї (1682 -1771) одним з перших звернув увагу на стан внутрішніх органів при різних хворобах і з'явився творцем патологічної анатомії. Він розглядав організм як суму самостійних органів. Біша (1771 -1802) є засновником вчення про тканини. Згідно з його вченням, тканини, складові орган, існують незалежно від нього. Біша нехтував мікроскопом; на приватних курсах з анатомії він розкрив за рік більше 600 трупів, створив трактат про 21 тканини. Таким чином, Біша, Морганьи, а пізніше (XIX століття) Вірхов встали на локалістіческіе позиції, приймаючи тканина, орган і клітку за основу, де розвиваються патологічні процеси. Такі уявлення хоча і були для того часу прогресивними, але з'ясувати сутність процесів, що протікають у хворому органі, тканини або клітці, цим вченим не вдалося, так як організм виключався як ціле. Концепція целлюлярной патології Вірхова (1821 -1902) послужила основою для створення патологічної гістології, але надалі вчення Вірхова стало значним гальмом на шляху пізнання патологічних процесів в організмі.

У Німеччині успішно працювали Меккель (1724-1774), який вивчав розвиток ембріона і будова голови, Врізберг (1739-1808), який окреслив хрящі гортані. Італієць Кальдані (1725-1813) видав перший атлас з анатомії людини, Масканьї (1752 -1815) опублікував великий трактат з малюнками про лімфатичної системі, Ськарпа (1747-1832) докладно описав кістки і органи чуття. Нідерландець Рюішь (1638-1731) і його дочка Рахель прославилися технікою бальзамування трупів і органів Ними була розроблена техніка ін'єкції судин різними речовинами. Петро I купив колекцію препаратів Рюиша за велику для того часу суму - 30 000 гульденів. Через 10 років Рюішь продав подібну ж колекцію до Польщі. Колекція препаратів в Росії зберігалася спочатку в музеї «Кунсткамера натуральних речей», а потім частина була передана у Військово-хірургічну академію і Казанський університет. Збережені препарати Рюиша і в даний час не втратили свого значення.

Лодер (1753-1832), професор в Єни, Галле і Московському університеті, прославився високою технікою виготовлення препаратів. Зоммерінг (1753 -1830) вивчав мозок, головні нерви і органи чуття. Чех Прохаська (1749-1820) вніс великий внесок у вивчення анатомії нервової системи. Ще до Мажанді і Белла Прохаська описав значення рухових і чутливих нервів. Він писав: «Ніяке м'язове рух не може здійснитися, якщо подразник, що впливає на чутливі нерви, не перейде в результаті деякого перемикання на рухові нерви і не викличе скорочення м'язів».

Необхідно відзначити, що на Заході до середини XIX століття розвиток описової анатомії призупинилося. Це пов'язано з тим, що для вивчення анатомії знадобилися інші методи дослідження і наукові підходи. У той же час відхід анатомів від описової макроскопічної анатомії пов'язаний з відкриттям клітини і широким впровадженням мікроскопічного методу в морфологічні дослідження.

Як же розвивалася анатомія в Росії? До XVII століття медицини як науки в Росії не існувало. Допомога хворим у кращому випадку надавали знахарі і ченці, причому деякі з них користувалися працями гіппократіков, Аристотеля і Галена. У період об'єднання князівств в єдине російське держава і під час багатьох воєн, які вела Росія за вихід до Балтійського і Чорного морів, потрібна медична допомога пораненим і хворим воїнам. У Москві в 1620 р. засновується Аптекарський наказ, який організовує медичне обслуговування і виготовлення медикаментів для армії. У 1654 р. при ньому створюється перша в Росії світська «Школа російських лікарів». У 1658 р. її закінчили 32 особи. Анатомія викладалася по керівництву Везалія «Епітом», переведеному у 1658 р. Єпіфаній Славенецкім на російську мову (переклад не зберігся). Вдруге «Епітом» переведений на російську мову в 1975 р. Таким чином, при підготовці лікарів в Росії викладання анатомії за працями Галена або Авіценни не велося і навчальними посібниками служили «Травники», «Лечебники» і «Докторські казки».

Певна система в підготовці лікарів була введена Петром I. За його розпорядженням були відкриті госпіталі: у Москві (1707), у Петербурзі - сухопутний (1718), в Кронштадті - морський (1719), в Архангельську (1733) і при них госпітальні школи підготовки лікарів. До кінця XVIII століття в 20 госпітальних школах Росії було підготовлено близько 2000 лікарів. Головним предметом у цих школах була анатомія, що вважалася «матерією медика». У 1786 р. госпітальні школи були перейменовані в медико-хірургічні училища. У Петербурзі організовується Медико-хірургічна академія (1798). Подібно західним країнам, у великих містах Росії (у Москві в 1755 р., в Казані і Харкові в 1804 р., у Варшаві в 1816 р., в Петербурзі в 1819 р., у Києві у 1834 р., в Одесі в 1865 м., в Томську в 1888 р.) були відкриті університети з медичними факультетами, явівшіміся колискою багатьох видатних російських вчених і лікарів.

Анатомією займався математик і фізіолог швейцарець Бернуллі (1700-1782), який вивчав значення нервів і кровоносних судин для діяльності м'язів, описав розташування жовтої плями сітківки ока.

Величезний вплив на розвиток науки і медицини в Росії надав М.В. Ломоносов (1711-1765) - великий учений-енциклопедист свого часу. Він зробив значний внесок у розвиток хімії, фізики, історії та медицини. Його прогресивні погляди зіграли велику роль у розвитку російської науки.

М. В. Ломоносов розробив учення про атомістичної будову матерії. Він першим заклав основи матеріалістичного вчення про єдність і цілісність організму. За наполяганням М.В.Ломоносова був відкритий Московський університет. Академіки-іноземці перешкоджали розвитку освіти в Росії. Академік Тауберг говорив: «Хіба де нам десять Ломоносових потрібно і один де нам в тягар».

Безпосередньо під впливом М.В.Ломоносова виховувалася плеяда російських лікарів: К. І. Щепін, Д. С. Самойлович. Ф. Г. Політковський, А. П. Протасов, С. Г. Зибелін, Н. М. Максимович-Амбодик, І. А. Сибірський, П. І. Погорецький, Н.І.Карпінскій, А. М. Філомафітскій і ін К. І. Щепін (1726-1770) почав викладання анатомії російською мовою замість латинської та грецької, А.П.Протасов (1724-1796) був першим російським академіком-анатомом, С. Г. Зибелін (1735-1802) вивчав індивідуальні особливості будови людини, розділивши людей по статурі на 4 типи. Він розвивав вчення Ломоносова про єдність і цілісність організму. У творі «Слово про причину внутрішнього союзу частин між собою ..." (1768) С. Г. Зибелін критикує ідеалістичну «клейову теорію» Галлера, обгрунтовуючи теорію взаємного тяжіння частинок. М. Шеїн (1712 -1762) перевів анатомічну термінологію на російську мову, створив атлас (1742) і переклав російською мовою підручник Гейстера. Н. М. Максимович-Амбодик (1744-1812) створив перший російський словник анатомічної термінології, був основоположником акушерства в Росії.

У 1798 р. організовується Санкт-Петербурзька медико-хірургічна академія (нині Військово-медична академія імені С. М. Кірова в Ленінграді). Першим завідувачем кафедри анатомії і фізіології цього видатного установи був проф. П. А. Загорський (1764-1846), творець анатомічної школи в Росії. П. А. Загорським написано більше 100 робіт з різних питань анатомії. Його перу належить перший російський підручник «Скорочена анатомія або керівництво до пізнання будови людського тіла для навчаються лікарській науці», що витримав 5 видань. Анатомічні дані в ньому викладалися у зв'язку з практикою хірургії. П. А. Загорський багато уваги приділяв російської анатомічної термінології. Продовжувачем П. А. Загорського був І. В. Буяльський (1789-1866), який, будучи студентом III курсу, виконував обов'язки помічника прозектора кафедри анатомії, а також брав участь у хірургічних операціях, вироблених проф. І.Ф.Бушем. Після закінчення академії І. В. Буяльський став прозектором кафедри анатомії, де протягом тільки 2 років виготовив 220 анатомічних препаратів; він вперше розробив техніку виготовлення корозійних препаратів. З 1833 по 1844 р. він завідував кафедрою анатомії в Медико-хірургічної академії, з 1831 р. по 1866 р. - кафедрою анатомії Петербурзької академії мистецтв. І. В. Буяльський багато уваги приділяв хірургії. У 1846 р. він був призначений на посаду «оператора-консультанта» всіх військово-навчальних закладів. Ним створено багато наукових робіт з анатомії, хірургії, фізіології, патології, терапії, акушерства, фармакології, офтальмології, гігієну, історії медицини, судової медицини і ветеринарії. Його найбільш великі праці - «Керівництво лікарям до правильного огляду людських тіл для узнанія причин смерті, особливо при судових дослідженнях» (1824), «Анатомо-хірургічні таблиці» (1829), «Анатомічні запису для навчаються живопису і скульптурі в Імператорської академії художеств» (1860). Праці І. В. Буяльського принесли російської медичної науці славу і заклали основу прикладного напрямку анатомії.

Є. О. Мухін є фізіологом-експериментатором; він також зробив великий внесок у розвиток анатомії. Їм опубліковано працю «Курс анатомії» у 7 частинах (1815). Він проголосив лікарський принцип: «Лікар не анатом не тільки марний, але й шкідливий». Продовжував розвивати російську анатомію і хірургію М. І. Пирогов (1810-1881), основоположник і творець прикладного напрямку анатомії - топографічної анатомії. Праця М. І. Пирогова «Хірургічна анатомія судинних стовбурів і фасцій» (1837) - видатна робота, що не втратила значення і в наш час. Його метод вивчення органів та інших утворень на розпиляних трупах дозволяє більш точно в тривимірному зображенні визначити їх проекцію і глибину залягання. Н. І. Пироговим створений «Повний курс прикладної анатомії людського тіла» (1843 -1848). М. І. Пирогов був видатний хірург, який розробив техніку багатьох операцій, успішно використав знання анатомії в практичних цілях. Він перший застосував у Росії загальний наркоз, гіпсову пов'язку, був творцем військово-польової хірургії як науки. З ініціативи М. І. Пирогова у Санкт-Петербурзької медико-хірургічної академії був організований анатомічний інститут, куди для роботи запросили в 1846 р. чеха В. Л. Грубера (1814-1890). За допомогою студентів він вивчав анатомію і аномалії органів, кровоносних судин, нервових стовбурів і м'язів на 30 000 трупах. Грубер організував анатомічний музей, де налічувалося більше 10 000 препаратів. На честь Грубера була вибита іменна медаль з написом «Вчителю восьми тисяч російських лікарів».

Говорячи про описової анатомії XIX століття, необхідно особливо зупинитися на видатному анатома, педагога П. Ф. Лесгафта (1837-1909). П. Ф. Лесгафт створив функціональний напрям в анатомії, показав формотворне значення функції, а також стверджував, що здоров'я людини багато в чому залежить від активної фізичної діяльності. На цій основі в СРСР створена система фізичних вправ і лікувальної фізкультури. П. Ф. Лесгафт першим застосував промені Рентгена для вивчення анатомії. Його праця «Основи теоретичної анатомії» (1892) не втратила актуальності і в даний час, оскільки містить абсолютно правильні принципи, що пояснюють взаємини форми і функції. У вступі до цієї книги П. Ф. Лесгафт писав: «... тільки яскраво світиться промінь науки в змозі освітити і простежити зв'язок між спостерігається зовнішньою формою і втілюваною нею діяльністю, тільки думка може зробити прозорим що знаходиться перед нами тіло і показати, як ця форма постійно згорає і знову відновлюється, змінюється у своєму виді і в своїх проявах ». Як прогресивний вчений свого часу П.Ф.Лесгафт виступив проти порядків, що панували в Казанському університеті. Звільнений з педагогічної роботи, він не шукав поблажливості і відстоював прогресивні ідеї. На кошти свого учня І. М. Сибірякова П. Ф. Лесгафт організував у С.-Петербурзі біологічну лабораторію, що стала першим науково-дослідною установою в нашій країні.

До створення матеріалістичного вчення про цілісність організму, його розвитку і функції в єдності з навколишнім середовищем в біології та медицині існувало механістичне уявлення. Клітинну теорію механіст (Вірхов) сприйняли неправильно і не сприяли її розвитку. У той час учені вважали, що організм являє колонію клітин, тому функція його в цілому вивченню не підлягає. Німецький фізіолог М. Ферворн писав: «... Всі проблеми життя таяться в клітці, а так як всі організми складаються або з однієї клітини, або з сукупності великого числа клітин, то фізіологія є в суті не що інше, як фізіологія клітини».

Російські морфологи і фізіологи завжди виступали проти законів, які заперечують ідею розвитку. Цьому сприяла та обставина, що в силу сформованих соціальних умов розвитку суспільства в Росії науки і медицина стали розвиватися пізніше, ніж на Заході. Після скасування кріпосного права (1861) у феодально-кріпосницької Росії відкрився шлях для буржуазних реформ і розвитку капіталізму. Університети отримали право вирішувати самостійно багато наукові проблеми, виникла земська медицина, що безсумнівно зробило позитивний вплив на розвиток медичної науки в Росії. Російські вчені, що знаходилися під впливом ідей передових людей свого часу: А. П. Радищева (1749-1802), А. І. Герцена (1812-1870), Н. А. Добролюбова (1836-1861), В. Г. Бєлінського (1811 - 1842). Д. І. Писарєва (1840-1868), Н. Г. Чернишевського (1828-1889) та ін, займали позиції стихійних матеріалістів. Тому багато ідеалістичні наукові концепції західних вчених не були прийняті в Росії, що вплинуло на розвиток ідей про цілісність організму і його зв'язку з навколишнім середовищем, про єдність фізичного і психічного. Основоположник російської фізіології І. М. Сєченов (1829-1905) з наукових матеріалістичних позицій сформулював проблему впливу зовнішнього середовища на організм людини. Він писав, що факти прогресу матеріальної організації «дають, по-перше, можливість визначити життя на всіх щаблях її розвитку як пристосування організмів до умов існування, по-друге, доводять, що зовнішні впливи не тільки необхідні для життя, але представляють в той же час фактори, здатні видозмінити матеріальну організацію і характер життєвих відправлень ». У своїй роботі «Рефлекси головного мозку» (1863) І. М. Сєченов зазначив, що різноманітні і найскладніші форми нервової діяльності представляють рефлекси. Відкриття цих рефлексів, по І. П. Павлову умовних, дозволило зрозуміти механізми, через які встановлюється зв'язок організму з зовнішнім середовищем.

Анатоми, які вивчають центральну нервову систему, виявили багато нових фактів. Так, В. О. Бец (1834-1894), професор Київського університету, описав клітинну будову різних ділянок кори півкуль головного мозку, великі пірамідні нервові клітини, що формують рухові імпульси. Ці відкриття показали, що кора має різні морфофункціональні особливості. Д. Н.Зернов (1843-1917), професор Московського університету, звернув увагу на різноманітність борозен, звивин кори головного мозку і узагальнив ці дані в книзі «Індивідуальні типи мозкових звивин у людини» (1877). Його дослідження є важливими в тому відношенні, що кора півкуль головного мозку слов'ян, негрів і турків не має расових типів, а володіє лише індивідуальними відмінностями. Тим самим Д. Н. Зернов рішуче виступив проти расистських теорій про вищих і нижчих раси.

Великий внесок у морфологію і фізіологію нервової системи внесли П. Брока (1824-1880), К. Бродман (1868-1918), К. Економо (1876-1931). Невропатолог і психіатр В. М. Бехтерєв (1857-1927) збагатив світову науку і, відкривши ряд мозкових центрів, ретельно досліджував провідні шляхи центральної нервової системи. У своїх дослідженнях В. М. Бехтерєв виходив з принципу єдності будови і функції мозку. Його погляди перегукуються з ідеями І. П. Павлова про обов'язкове відповідно деталей конструкції та динамічних явищ в нервовій системі. Багато років робота В.М.Бехтерева «Провідні шляхи головного та спинного мозку» (1894) найбільш повно висвітлювала це питання. П. В. Рудановский, вивчаючи будову спинномозкових корінців спинного і довгастого мозку, вперше застосував заморожування препаратів для виготовлення гістологічних зрізів (1865). А. С. Догель за допомогою методу Ерліха, прижиттєвої забарвлення нервових елементів метиленової синню, описав кілька типів нервових клітин і нервових закінчень у соматичної і вегетативної нервової системах.

І. П. Павлов (1849-1936) на основі вивчення функцій кровообігу, травлення та вищої нервової діяльності продовжив і розвинув вчення І. М. Сєченова про центральній нервовій системі. Вчення І. П. Павлова та його учнів, що базується на величезному фактичному матеріалі, представляє зразок розуміння науки з позицій діалектичного матеріалізму. Умовні рефлекси - це механізми, які дають вищим тваринам можливість тонкого і точного пристосування до різноманітних умов зовнішнього середовища. Через умовний рефлекс реалізуються мінливість і пристосовність організмів. Як остаточно встановлено І. М. Сєченова та І. П. Павловим, мозок є не тільки органом психічної діяльності, але і регулює життєві функції організму, що знаходить підтвердження в практиці медицини.

Таким чином, до початку XX століття були накопичені численні дані і анатомію починають вивчати в усіх цивілізованих країнах.