Важливим доказом того, що медицина і релігія виникли в різний час, є життя відсталих народів і племен Азії, Африки та Америки, які знаходяться на рівні раннього родового ладу і не мають релігії, але володіють медичними знаннями. У Європі релігія виникла приблизно 20000 - 30 000 років тому. Інститути, які елементи медицини поступово вбирали уявлення про надприродною силою дії ліків. У деяких народів медицина взагалі стала культом. Наприклад, в Давньому Єгипті медициною займалися жерці, в Росії - довгий час монахи. Оскільки різні культові дії не могли надати допомоги хворим, вимушено застосовувалися і інші методи лікування, іноді приводили до одужання. У цілому втручання церкви в медицину заподіяло величезний моральний і фізичний шкоду. З одного боку, професійне невігластво, засноване на вірі в бога, з іншого - релігія душили прояви нового в усіх галузях знань. Наука взагалі не могла розвиватися на основі теологічного вчення про створення світу і походження органічного життя, так як церква вела боротьбу з новими ідеями і особливо з науковою медициною, що стоїть на шляху пізнання людиною самої себе. У кращому випадку церква заохочувала шаманство і знахарство. Духовенство зраджувало прокляттю своїх ідейних супротивників, забороняло застосовувати нові методи лікування, фізично розправлявся з ученими, ніж гальмувало розвиток медицини впродовж тисячоліть. Прогрес науки підривав авторитет релігії і «чудодійних» засобів зцілення, на чому церква наживала величезні доходи. «Святий» Амвросій заявляв, що «... приписи медицини суперечать небесному знанню, пильнуванню і молитві ».

Найбільш виразним проявом боротьби релігії проти медицини була заборона церкви вивчати будову людини. Ця заборона завдав величезної шкоди розвитку медицини. В результаті невігластва лікарів багато тисяч хворих поплатилися життям. Недарма навіть у період розгулу мракобісся і релігії на початку XIII століття Салернский король Фрідріх II звернувся до духовенства та населення з проханням дозволити лікарям хоча б один раз на 5 років виробляти розтину. Заборона церкви розкривати трупи пояснювався тим, що людина-це храм святого духа; на день страшного суду людина повинна воскреснути таким, яким він був, що церква «з огидою ставиться до проливанию крові». Останній аргумент вельми лицемірний, оскільки церква в період інквізиції в боротьбі з науковими знаннями, з «нечистою силою» знищила мільйони людей. У вогнищах згорали одночасно сотні людей і були селища, де залишалися всього 2-3 жінки, не знищені інквізицією. Було б величезним нещастям для людства, якби релігія зайняла панівне становище, як у період середньовіччя.

У 1553 р. в Женеві за вказівкою протестантського діяча Кальвіна був живцем спалений іспанський учений і просвітитель М. Сервет, що відкрив мале коло кровообігу, за те, що він намагався проникнути в «справи божі».

Реформатор анатомії Везалий також став жертвою церкви. Незважаючи на заборону папи Боніфація III, Везалий препарував трупи. Щоб не викликати підозр, він ховав трупи в своєму ліжку і, працюючи у вічному страху і самітництві, все ж створив працю «Про будову людського тіла», яким зруйнував схоластичну анатомію Галена, Арістотеля і Авіценни. Везалий спростував багато догми, освячені церквою. Наприклад, він встановив, що у чоловіка і жінки 24 ребра, Біблія ж вчила, що у чоловіка 23 ребра, так як з 24-го богом була створена жінка. Потім Везалий спростував існування у людини неспаленої кісточки, яка в день страшного суду має дати поштовх до воскресіння з мертвих. Природно, такий кісточки не виявилося. Церква звинуватила Везалія в богохульстві. Деякий час інквізиція не могла виконати свої наміри відносно Везалия, але після смерті іспанського короля Карла V, який протегував йому, таємний суд інквізиції засудив Везалия до покаяння. Він повинен був босоніж пройти шлях з Іспанії в Єрусалим і замолити біля труни господня свої гріхи. Приводом до суду послужила версія, очевидно, вигадана інквізицією, що Везалий розкрив живу світську даму. Навряд чи ймовірно таке твердження, бо Везалий був искуснейшим лікарем свого часу. Не випадково він багато років був придворним лікарем Карла V і Філіпа II, супроводжував їх на постійних і важких походах і в зв'язку з цим змушений був залишити анатомічні дослідження. Везалий попрямував до Єрусалиму і в 1564 р. по дорозі на батьківщину корабель зазнав аварії. Везалий був викинутий на берег о. Занте, де важко захворів. Він помер 15 жовтня 1564 в злиднях і самотності.

Заборони розкривати і препарувати трупи з науковими цілями існували і в Росії. Так, в 1820 р. попечитель Казанського навчального округу М. Л. Магніцький під тиском реакційної професури заборонив розкривати трупи на медичному факультеті Казанського університету. Під дзвін дзвонів і молебень були поховані навчальні експонати і музей університету, в тому числі і препарати, виготовлені Рюиша і куплені Петром I. Вивчати анатомію дозволялося тільки за малюнками. Церква порушила судову справу проти І. М. Сеченова після виходу його роботи «Рефлекси головного мозку» (1863). І. М. Сєченов звинувачувався в тому, що психіку людини він пояснював ні з релігійних позицій, а матеріальними причинами. В обвинувальному акті вказувалося: «Ця матеріалістична теорія, відкидаючи вільну волю і безсмертя душі, не згодна ні з християнським, ні з кримінально-юридичних поглядах» Навіть у наш час, коли італієць Петруччі здійснив запліднення поза організмом жіночої яйцеклітини і протягом 2 міс вирощував плід, він змушений був припинити експеримент під тиском церкви.

В даний час церква прагне застосувати тактику примирення релігії та науки. У США до лікарів ставиться вимога розвивати союз релігії з наукою; лікар повинен визнавати бога, а потім тільки орієнтуватися на медичну науку.

На прикладі медицини та анатомії видно, яку боротьбу веде церква з усіма новими проявами лікарського мистецтва, заснованого на практиці, досвіді, експерименті та теорії пізнання, а не на вірі в створення боже. Факти закликають вчених до боротьби з релігією і знищенню забобонів, викриттю старих і нових ідеалістичних філософських течій. Радянські вчені, збройні марксистсько-ленінською теорією пізнання, спираються на науку, яка представляє рушійну силу розвитку суспільства.

Марксизм-ленінізм щодо релігії грунтувався на тому, що вона завжди є соціальною. При зміні суспільних формацій відзначається зростання атеїстичних тенденцій. Так було в період буржуазних і соціалістичних революцій. Втрата престижу віри в бога пояснюється тим, що кожна суспільна формація сприяє створенню більш високого науково-технічного рівня, вищої культури і самосвідомості пригноблених верств суспільства. Те ж спостерігається і в період національно-визвольного руху, коли боротьба народу за свою свободу веде до зростання національної самосвідомості, переоцінці існуючої культури, перебудові релігійного сприйняття світу і задоволенню духовних запитів не релігійною містикою, а шляхом реальної оцінки існуючої дійсності. В даний час в усьому світі відзначається занепад релігії. Величезну роль у цьому відіграє успішний розвиток країн соціалістичної співдружності, об'єднаних комуністичним світоглядом. Загострення кризи і зростання класової боротьби в капіталістичних країнах переконливо демонструють порочність буржуазного ладу і релігій як форм ідеологічного впливу на маси. Матеріалістичне вчення про релігію грунтується на теорії і практиці наукового атеїзму в тісній співдружності з завданнями антиімперіалістичної боротьби трудящих, коли розкривається соціально-класовий характер релігії, показується несумісність релігії і марксистсько-ленінської ідеології, релігії і науки, релігії і прогресу. Ось чому з перших кроків Радянської влади церква була відокремлена від держави, тим самим дозволивши свободу атеїзму і віросповідань. Як вчить марксизм-ленінізм, боротьба з релігією може бути успішною тільки при знищенні старих суспільних відносин, заснованих на експлуатації і соціальному рабстві. У соціалістичному суспільстві відбулося звільнення від соціального і духовного гноблення, що призвело до формування нової людини, позбавленого релігійних забобонів, виступаючого проти клерикальних концепцій. Програма Комуністичної партії Радянського Союзу орієнтує на науково-матеріалістичний світогляд. З ростом комуністичної свідомості релігія і забобони поступово зникнуть і будуть представляти тільки історичний етап на шляху торжества свободи людської особистості і комуністичної моралі.