Аналіз кала на дисбактеріоз полягає у визначенні видового та кількісного складу мікрофлори кишечника, стан якого вкрай важливо для нормального функціонування всього організму. Близько 90% нормальних дружніх бактерій кишечника складають біфідобактерії і лактобактерії. Інші 10% припадає на бактероїди, пептококи, стафілококи, стрептококи, клостридії, еубактеріі, дріжджоподібні гриби, умовно патогенні ентеробактерії і кишкову паличку. Для кожного виду бактерій існують допустимі кількісні норми.

Дисбактеріоз полягає в зниженні кількості нормальних бактерій і, відповідно, в підвищенні вмісту інших живуть в кишечнику бактерій або появі чужорідних видів бактерій або грибів.

Кал на дисбактеріоз слід здавати до призначення антибіотиків або як мінімум через 12 годин після їх скасування, а також через 3-4 тижні після закінчення курсу еубіотиків і пробіотиків. За 3-4 дні до дослідження скасовуються всі проносні препарати, а також будь-які ректальні свічки, не можна також збирати кал, отриманий після клізми. Кал збирається в одноразовий контейнер, який попередньо видається в лабораторії. Не допускається попадання в контейнер сечі. Контейнер повинен бути обов'язково щільно закритий. У лабораторію аналіз повинен бути доставлений протягом 3 годин, при цьому зберігати його бажано в холоді.

Аналіз виконується протягом 7-10 робочих днів.