Розщеплення ДНК метилированої

Метилювання ДНК - це процес перенесення метилтрансферазой метильної групи від молекули донора до молекулі цитозина або аденіну.  Такого типу метилювання є найбільш поширеним процесом модифікації ДНК в живих організмах.  Переважно три типи метильованих підстав знайдені в ДНК: 1) 5`-метилцитозин (5mC); 2) N4-метилцитозин (m4C); 3) N6-метиладенин (m6A). 

У прокаріотів, розщеплення ДНК спорідненими ферментами попереджено метилированием ДНК сайт-специфічними метилтрансферазами, які є невід'ємною частиною кожної системи рестрикції-модифікації.  Більшість штамів кишкової палички використовуються для розмноження плазмідної ДНК містять дві сайт-специфічні ДНК-метилтрансферази - Dam і Dcm.  Метилаза, що кодується геном dam метилирует N6-положення аденіну з послідовністю GATC.  Метилаза, що кодується геном dcm, метилирует С5-положення внутрішнього залишку цитозина в послідовності CCWGG. 

ДНК вищих эукариотических організмів має залишками 5-метилцитозина в CpG або CpNpG контекстах.  Ці тканеспецифические ознаки наследуемы.  Вони беруть участь у регуляції експресії генів і клітинної диференціації. 

У випадках, коли цільової сайт рестрикції перекривається з метилированным сайтом наступні результати розщеплення можливі: 1) не впливає; 2) часткове гальмування, 3) повна блокада. 

Для досягнення ефективного розщеплення ДНК, необхідно враховувати і тип метилированной ДНК і чутливість рестриктази до метилированной ДНК. 

Однолітерний код (для опису сайтів рестриктаз)

R = G або A; Y = C або T; W = A або Т; М = А або C; K = G або T; S = C або G; H = A, C або T; V = A, C або G; B = C, G або T; D = A, G або Т; N = G, A, T і C; (A, T, G, С - азотисті основи).