Основоположником анатомії і фізіології в Греції вважається Алкмеон Кротонський, першим написав книгу по анатомії в кінці VI - початку V століття до н. е.. Він розкривав трупи тварин і вказав, що головний мозок є осередком відчуттів і мислення, усвідомив значення нервів для органів почуттів, перший створив теорію відчуттів і показав, що тварини мають відчуттями, а людина не тільки відчуває, а й мислить. Ця особливість відрізняє людину від тварин. На думку Алкмеона, хвороба полягає в порушенні рівноваги вологого або сухого, теплого або холодного, гіркого або солодкого і т. д. Визнаючи матеріальність живого, він вірив у матеріальність душі.

Основи стихійного матеріалізму, закладені у філософії іонійськими натурфілософами, були розвинені в Стародавній Греції Левкиппом (V століття до н. Е..), Анаксагором (500-428 рр.. До н. Е..) І Емпедоклом (492-432 рр.. До н. е..). Вони розглядали будову і походження світу з позицій античної атоміческіе теорії, яка будувалася на тому, що з дрібних частинок «насіння» складаються всі рослини і тварини. Наприклад, Анаксагор не міг визначити тварин і рослини по їх будовою і функціями. Він вважав, що рослини і тварини здатні думати, відчувати, засмучуватися, радіти і мислити; людина відрізняється тим, що у нього є руки. У процесі травлення, на думку Анаксагора, частинки м'язів з'єднуються з м'язами, крові - з кров'ю, серця - з серцем і т. д. Вчення атомістів відіграло певну роль у створенні ідеї про природне походження живих істот, що було дуже прогресивним і протилежним релігійним вченням про божественне походження людини. Це вчення було продовжено Демокритом (460-370 рр.. До н. Е..), Який вважав, що атоми вічні і незмінні, ніким не створені і не можуть бути знищені, життя - з'єднання атомів, смерть-роз'єднання. За Демокріту, всі живі істоти походять з мулу, який в результаті гниття під дією сонця дав початок живим істотам. Зародок розвивається з насіння, що містить частинки всіх частин тіла. Це суперечило думці, що склалася, що насіння (статеві клітини) є продуктом мозку.

Сучасником Демокріта був Гіппократ (460-377 рр.. До н. Е..), Найбільший лікар античного світу, основні ідеї якого знаходять застосування і в сучасній медицині. Гіппократ був сином лікаря (в ті часи професія лікаря передавалася у спадок). Вже в 20 років Гіппократ був знаменитий як лікар. Про внесок Гіппократа в медицину ми можемо судити по книгах, об'єднаним через 100 років після його смерті в так званий Гиппократов збірник. Ця збірка представляє звід медичних знань доаристотелевской періоду і названий медициною гіппократіков. Гіппократ був практичний лікар, і його матеріалізм висловлювався в тому, що, відкидаючи втручання надприродних сил у виникнення і розвиток хвороби, він визнавав спостереження і досвід. Гіппократ надавав значення в розвитку хвороби факторів зовнішнього середовища, враховуючи вік і спосіб життя хворого.

Принцип гіппократіков полягав у тому, що треба лікувати не хворобу, а хворого. Філософія життя, за Гіппократом, будувалася на вогні, воді, повітрі, землі та їх властивості (теплий, холодний, вологий, сухий). Він створив вчення про рідинах, які входять в певних пропорціях до складу організму. Гіппократ вважав, що якщо кров, слиз, жовта жовч і чорна жовч кількісно і якісно змішуються правильно, то організм буде здоровий. Це вчення було дуже прогресивним для того часу.

Будучи прекрасним лікарем, Гіппократ природно прагнув пізнати будову людини. Він і його учні мали більше уявлення про анатомію, ніж лікарі країн Стародавнього Сходу, але безсумнівно і те, що Гіппократ сам недостатньо знав анатомію. У книгах часів Гіппократа найкраще містилося будову кісток, ймовірно, тому, що їх часто знаходили вивітреними на поверхні грунту. Досить докладно були описані кістки черепа, хребці і ребра. Перший хребець ще не був відомий. Мало знали вони і про м'язах, які узагальнювались поняттям «м'ясо». У часи Гіппократа багато сухожилля і нерви не ідентифікувалися, але розрізняли слуховий, зоровий, трійчастий і блукаючий головні нерви, плечовий, міжреберні і сідничний спинномозкові нерви. З внутрішніх органів були відомі шлунок і кишечник (як один орган), печінку і жовчний міхур, селезінка, нирка, сечовий міхур, лімфатичні і молочні залози. Головний мозок приймали за залозу, що виробляє рідину і насіння, але вже були здогадки, що мозок виконує і психічні функції.

Гіппократіков вважали, що в серці є шлуночки, передсердя, клапани та судини. Вдихаємо повітря служить для охолодження серця. Про рух крові були смутні уявлення. У очному яблуці описувалися три оболонки, крім сітчастої. Склоподібне тіло приймалося за зорову рідина. Якщо у збірнику Гіппократа і зустрічаються точні анатомічні дані, то вони були отримані не Гіппократом, а іншими авторами. Є припущення, що навіть присяга лікаря відноситься до давнішого періоду, ніж життя Гіппократа. Подання про ембріональний розвиток людини і тварин грунтувалося на поглядах Демокріта.

У IV-III століттях до н. е.. на противагу матеріалістичним уявленням Демокрита і Гіппократа виникло ідеалістичне вчення Платона (429-347 рр.. до н. е..), що пояснює матеріальний світ недосконалим відображенням осягаються розумом ідей. Життя на Землі виникла з появою людини, створеної богом. Різноманіття тваринного світу - результат відхилення від звичайного розвитку людей. На думку Платона, мозок є вмістилищем безсмертної частини душі, а в серці і животі мешкають її смертні частини. Вчення про три душах зробило певний вплив на погляди Аристотеля (384-322 рр.. До н. Е..), Який був учнем Платона протягом 20 років.

Аристотель - великий вчений Стародавньої Греції, вихователь Олександра Македонського, творець величезної праці «Історія тварин». З його 400 робіт, присвячених різним галузям знань, 4 великих і 11 малих трактатів містили систематичні дані того часу з зоології та ботаніки. Аристотель більш докладно, ніж у період гіппократіков, описав нерви головного мозку. У своїх філософських судженнях він плутав матеріалістичні і ідеалістичні уявлення про світ. Наприклад, пасивна матерія містить активну форму, що має божественне начало. Аристотель, як і його вчитель Платон, виділяв душу трьох видів. Рослини мають тільки живильну душу, тварини наділені живильної і чувствующей душами, а людина, окрім двох, має власної розумною душею. У відношенні анатомічних даних у нього була впевненість, що людина має внутрішні органи, подібні тваринам. Аристотель був не згоден з тими вченими, які вважали діафрагму центром мислення, і приписував їй роль перегородки між грудьми і животом. Описані їм анатомічні дані були отримані при розтині тварин або запозичені в інших авторів, а часом наводилися і фантастичні вигадки, особливо при поясненні призначення органів. У праці «Драбина природи» Аристотелем зроблена спроба зіставити різних тварин і встановити не тільки їх відмінності, але і схожість. Їм було зроблено важливий матеріалістичний висновок, що усяка тварина походить від тварини.