Збільшення числа збудників інфекцій у людини, різноманіття форм їх біологічної організації і різне медичне значення диктують необхідність поглиблення знань кожного лікаря в галузі клінічної мікробіології. Збудники інфекцій людини не представляють собою будь-яких відокремлений клас, сімейство або рід. Зазвичай вони, поряд з непатогенними для людини організмами, входять у склад того чи іншого таксону (класифікаційної групи). Більш того, лише остання класифікація бактерій, представлена у всесвітньо визнаному "Керівництві по систематиці бактерій Берджі”, містить ясні вказівки про медичне значення представників конкретних таксономічних груп .
Класифікація В цілому класифікація збудників інфекцій людини передбачає виділення 6 основних груп (в порядку ускладнення їх організації): пріони, віруси, бактерії, грибки, найпростіші та гельмінти. Вони є збудниками, відповідно, пріонних, вірусних, бактеріальних, грибкових (мікози), протозойних інфекцій і гельмінтозів.
Найменш вивченим є новий клас інфекційних агентів, названих пріонами. Вони являють собою білкові частинки, які не містять у своєму складі визначених кількостей ДНК або РНК, але здатні стимулювати накопичення в нейронах людини особливого прионного білка. Пріони пов'язують з розвитком деяких повільних нейроинфекций людини і тварин.
Віруси відрізняє ряд особливостей: неклеточное будова, наявність лише одного типу нуклеїнової кислоти (тільки РНК або тільки ДНК), нездатність самостійно синтезувати білки і забезпечувати себе енергією. В результаті цього для них характерний абсолютний внутрішньоклітинний паразитизм (у тому числі з інтеграцією вірусного генома в геном клітини хазяїна) і відсутність росту на штучних живильних середовищах (для культивування вірусів використовують зараження живих клітин).
Бактерії представляють, у порівнянні з вірусами, більш високий (клітинний рівень організації. Вони відносяться до одноклітинним прокариотическим мікроорганізмів. Геном бактерій представлений кільцеподібної молекулою ДНК з гаплоидным набором генів, що лежить безпосередньо в цитоплазмі клітини (нуклеоид). Крім того, для бактерій характерно бінарне поділ (відсутність мітозу і мейозу); відсутність спеціалізованих органел; наявність пептидоглікану в клітинній стінці, виражені адаптаційні властивості та ін.
Гриби, найпростіші та гельмінти є представниками эукариотических (одноклітинних або багатоклітинних) організмів, які відрізняються від бактерій більш високим рівнем біологічної організації. Для еукаріотів характерні наявність оформленого ядра, в якому знаходиться набір лінійних хромосом з диплоїдним набором генів; мітотичний поділ; статеве розмноження; різні органели (мітохондрії, ендоплазматична сітка, комплекс Гольджи та ін).
Гриби являють собою самостійне царство одноклітинних і багатоклітинних эукариотических організмів, що мають схожість з рослинами (нерухомі, для багатоклітинних грибів характерний необмежений верхівковий ріст, мають жорстку клітинну стінку, зазвичай складається з полісахаридів). Як і патогенні бактерії, гриби живляться органічними речовинами, за типом дихання є аеробами. Клітини, як правило, багатоядерні, з подвійною ядерної оболонкою. Розмноження вегетативне (фрагментація або брунькування), безстатеве (різні варіанти спір) і статеве.
Прості являють собою одноклітинні эукариотические організми. Їм властиві різноманітні форми безстатевого і статевого розмноження. У багатьох найпростіших в результаті чергування форм розмноження складаються складні життєві цикли, в тому числі зі зміною декількох господарів, можуть утворювати цисти (кілька особин, вкритих загальною оболонкою).
Гельмінти (черв'яки) являють собою збірну групу нижчих безхребетних тварин, що включає кілька типів (наприклад, трематоди, плоскі черв'яки та ін). Мають характерну будову тіла, складний цикл розвитку, що включає личиночную стадію. Господар зазвичай заражається гельмінтами через їжу і воду (захоплюючи інвазійні яйця і личинки), в результаті активного проникнення личинок через покриви і при внутрішньоутробної інфекції плода. Личинки деяких гельмінтів потрапляють в організм остаточного хазяїна при поїданні їм проміжного хазяїна.
Ідентифікація і номенклатура При дослідженні клінічного матеріалу основним завданням є вивчення властивостей виявлених у ньому мікроорганізмів, порівняння їх з властивостями відомих видів і віднесення невідомого штаму до того чи іншого виду (ідентифікація). Зазвичай ідентифікацію ведуть за найбільш важливими класифікаційними ознаками. Наприклад, для бактерій - це відношення до фарбування за Грамом, культуральні властивості і особливості метаболізму, для грибів - морфологія, культуральні та біохімічні властивості, для вірусів - культуральні та антигенні властивості .
Точно ідентифікований збудник отримує назву, що відповідає його систематичного положення. При цьому важливо, щоб фахівці застосовували уніфіковані (загальноприйняті) сучасні назви збудників інфекцій. Назви збудників бактеріальних, протозойних інфекцій, мікозів та гельмінтозів складаються з двох назв (біноміальна номенклатура) - родового і видового (наприклад, Streptococcus pneumoniae). У назвах вірусів біноміальна номенклатура не застосовується (прийняті латинські назви лише великих таксонів - сімейств, родів). Хоча в родовій та видовій назві мікроорганізму часто відображені властивості збудника та характер інфекції, їх, звичайно, не можна сприймати буквально.
Патогенність Представники різних форм життя в ході еволюції набули здатність при попаданні в організм людини не тільки виживати, але і завдавати йому шкоди.
Для випадкових перебування паразитів в організмі хазяїна є коротким епізодом у порівнянні з періодом існування в інших середовищах. Факультативні паразити зберігають здатність до самостійного існування у зовнішньому середовищі. Облігатні паразити є залежними від свого господаря і нездатні до самостійного існування у зовнішньому середовищі.
Зважаючи сформованих закономірностей виникнення і розвиток інфекційного процесу залежить від ряду умов: патогенний і досить вирулентный збудник повинен потрапити в яка інфікує дозі через ворота інфекції в сприйнятливий неиммунный або ослаблений макроорганізм. Головною з цих умов є наявність у патогенного мікроорганізму потенціалу - патогенності.
Патогенністю називають вироблену в ході еволюції здатність мікроорганізмів певного виду при влученні в сприйнятливий організм (середовище господаря) викликати розвиток інфекції. Патогенність є якісним наслідуваним ознакою всіх представників даного біологічного виду. Цей ознака треба розглядати стосовно до конкретного господаря: патогенний для людини вид може бути непатогенным для тварин і навпаки. У відповідності з наявністю і величиною патогенного потенціалу мікробні види прийнято поділяти на 3 групи: безумовно-патогенні (патогенні), потенційно-патогенні (умовно-патогенні, опортуністичні) і непатогенні.
Мікроорганізми безумовно-патогенних видів, як правило, не зустрічаються в складі нормальної мікрофлори здорового організму господаря і при попаданні в нього завжди викликають розвиток інфекції. Їх нозологічна специфічність полягає у своєрідності закономірно розвивається інфекційного процесу (Corynebacterium diphtheriae викликають тільки дифтерію, Salmonella typhi - черевний тиф тощо). У свою чергу специфіку інфекційного процесу (клінічні прояви, динаміку, результат захворювання) визначають вхідні ворота інфекції, шляхи розповсюдження в організмі господаря, поражаемые тканини і характер уражень, що залежить від конкретних патогенних властивостей того чи іншого збудника. Інфекції, викликані такими збудниками, які називають класичними.
Мікроорганізми потенційно-патогенних видів досить часто виявляються в складі мікрофлори здорових людей і викликають розвиток інфекції лише при особливих умовах (дефекти або загальне зниження антиінфекційної резистентності організму, масивність інфікування, потрапляння в організм варіанти збудника з підвищеним патогенним потенціалом). Розвивається при цьому інфекційний процес, як правило, не має вираженої специфіки: для збудників цієї групи характерний широкий діапазон розбито тканин, варіабельність по тяжкості і динаміці захворювання.
Лікарська тактика суттєво відрізняється при класичних і опортуністичних інфекціях. Так, виявлення в клінічному матеріалі безумовно-патогенного мікроорганізму (в будь-якій кількості) однозначно підтверджує діагноз, в разі умовно-патогенного для цього будуть потрібні додаткові обґрунтування.
Мікроорганізми непатогенних видів (наприклад, Saccharomyces cerevisiae - пекарські дріжджі, Lactococcus lactis - молочнокислий стрептокок і багато інших) не мають патогенним потенціалом і, як правило, не здатні викликати інфекції.
Вірулентність Кожен штам або клон мікроорганізмів патогенної або умовно-патогенного виду має свою (індивідуальну) ступінь вираженості патогенного потенціалу - вірулентність. На відміну від патогенності, ця характеристика має кількісне вираження, яке може змінюватися під впливом різних причин) у одного і того ж штаму.
Вірулентність складається з ряду патогенних властивостей мікроорганізму: адгезивності (здатність мікроорганізму розпізнавати і міцно зв'язуватися з поверхнею клітин господаря), інвазивності (здатності до внутрішньоклітинного і позаклітинного проникненню і розповсюдженню збудника в тканинах господаря), персистентних властивостей (антифагоцитарні, антикомплементарные, антигенна мімікрія та ін) - здатність ухилятися від захисних реакцій макроорганізму або долати їх; цитотоксичності (здатність пошкоджувати клітини господаря); токсичності і токсигенності (здатність до синтезу токсинів, що порушують функції органів і систем господаря).
Штами можуть бути згруповані по вираженості окремих патогенних властивостей, наприклад, высокоинвазивные, помірно - або низкоинвазивные, неінвазивні. Згідно з найбільшою виразністю того чи іншого патогенного властивості мікроорганізми можуть отримувати спеціальні назви і позначення, наприклад, энтеротоксигенная кишкова паличка, виділяє екзотоксин з переважною дією на кишковий епітелій.
Вираженість патогенного властивості залежить від наявності в мікроорганізму відповідних генів патогенності і контрольованих ними факторів патогенності - структур і речовин, які забезпечують взаємодію з макроорганизмом в ході інфекції. До факторів патогенності, зокрема, відносять багато поверхневі структури мікроорганізмів (ворсинки, капсулу), компоненти зовнішньої мембрани і клітинної стінки (ліпополісахарид, білки адгезины і инвазины, тейхоевые кислоти), що виділяються збудником ферменти і токсини. Зміна вірулентності штаму може бути результатом придбання або втрати тих чи інших факторів патогенності, а також наслідком зміни вираженості патогенних властивостей. В основі цих процесів лежать закономірності функціонування генів патогенності, мутації, а також перенесення генів між організмами одного або різних видів.
Практичне значення питань класифікації Систематичне положення збудника інфекції нерідко визначає вибір оптимального методу діагностичного дослідження. Наприклад, мікроскопічний метод діагностики є основним при гельмінтозах мікозах і протозойних інфекціях зважаючи на відносно великих розмірів і яскравих морфологічних відмінностей їх збудників. Для діагностики бактеріальних інфекцій, збудники яких часто не мають диференціюючих морфологічних ознак, основним методом є культуральний. Вкрай малі розміри вірусів і відсутність у них здатності до росту на штучних живильних середовищах служать підставою для вибору інших методів діагностичного дослідження (наприклад, серодіагностики).
Систематичне положення збудника має не менш важливе значення при виборі засобів антимікробної терапії та профілактики. Відомо, що хіміопрепарати, наприклад антибіотики, відрізняються вибірковою дією на мікроорганізми. Антибіотик, як правило, має одну або кілька "точок додатка” в бактеріальної клітці (специфічних життєво важливих для мікроорганізму структур або ферментів), пошкодження яких веде до бактериостатическому (оборотного) або бактерицидної (необоротного) дії на збудника. Наявність у відповідних збудників "точок додатка” і здатність антибіотика досягати їх визначають антимікробну активність антибіотика і спектр його дії на різні групи мікроорганізмів. Крім того, призначення антибіотиків безглуздо при грибкових та вірусних інфекціях з огляду структурно-функціональних відмінностей вірусів, прокаріотів і еукаріотів.
Висновок Таким чином, класифікаційне положення збудника інфекції відображає його властивості: ті, які мають значення в патогенезі інфекції у людини, і ті, які дозволяють успішно проводити мікробіологічні дослідження, спрямовані на виявлення збудника в клінічному матеріалі і оцінку його чутливості до антимікробних впливів. Знання цих властивостей збудників повинно сприяти поліпшенню контролю за інфекційними захворюваннями людини. | 
