Лізосоми - мембранні пухирці, які наповнені гидролитическими ферментами.

Лізосоми містять такий набір гідролаз, що вони можуть деполимеризовать абсолютно будь-полімер, наявний в організмі - ліпід, білок, полісахарид і нуклеїнова кислота. Природно, що такого роду ферменти зобов'язані ізолюватися від інших частин клітини, інакше вони можуть чинити на неї руйнівну дію. Дані ферменти лізосом, є білком, і потрібно захистити їх від впливу протеолітичного ферменту. Ферменти лізосом високо гликозилированы, внаслідок чого для протеаз вони є поганими субстратами.

Лізосоми можуть поглинати і руйнувати компоненти, що утворюються в процесі гетерофагии.

Тут ці компоненти надходять у клітку шляхом эндоцитоза та аутофагії. Вмісту лізосом притаманна кисле середовище (рН 1,5), реакція ж в інших частинах клітини нейтральна. Кисле середовище лизосома утворюється за дії Н+-Атфази в мембрані, яка перекачує протони в лізосоми. Лизосома і плазматична мембрана, що утворюються в пластинчастому механізмі. Утворені таким шляхом лізосоми іменуються первинними лизосомами.

Найбільшим результатом взаємодії руху лізосом і эндоцитоза є гетерофагия. По-іншому, це процес утворення вторинних лізосом, які утворюються в процесі зливання эндоцитозных бульбашок в цитоплазмі з первинними лизосомами. Весь вміст эндоцитозных бульбашок в лизосоме вторинної деполімеризує, а мономери утилізуються. 

Мікроорганізми, які можуть паразитувати всередині клітини (бруцельоз, збудник прокази, туберкульоз та ін), або інші використовують механізм эндоцитоза, щоб проникнути в клітину. Руйнівного впливу лізосом мікроорганізми-паразити уникають різними способами: в одних є інгібітори, що перешкоджають злиттю эндоцитозного пляшечки з лизосомой; в інших налагоджено механізми захисту від лізосомного ферменту, за рахунок цього механізму вони можуть паразитувати всередині лізосом.