Під дисбактеріозом кишечника розуміють клініко-лабораторний синдром, пов'язаний зі зміною якісного та/або кількісного складу мікрофлори кишечнику з подальшим розвитком метаболічних та імунологічних порушень з можливим розвитком шлунково-кишкових розладів.
Співвідношення різноманітних популяцій мікробів окремих органів і систем, що підтримує біохімічне, метаболічну та імунологічне рівновагу, необхідне для збереження здоров'я людини, називають нормофлорой.
Концентрація мікробних клітин, їх склад і співвідношення змінюється в залежності від відділу кишечника. У здорових людей у дванадцятипалій кишці кількість бактерій становить не більше 104 -105 ДЕЩО на мл вмісту. Видовий склад бактерій: лактобактерії, біфідобактерії, бактероїди, ентерококи, дріжджоподібні гриби та ін. З прийомом їжі кількість бактерій може значно збільшуватися, але в короткий термін їх кількість повертається до вихідного рівня.
У верхніх відділах тонкої кишки визначаються мікроорганізми в невеликій кількості, не більше 104 -105 КУО/мл вмісту, у клубовій кишці сукупна кількість мікроорганізмів становить до 108 КУО/мл хімусу.
Основними механізмами, що перешкоджають їх росту в тонкій кишці, є антибактеріальну дію жовчі; кишкова перистальтика, що забезпечує швидке видалення мікроорганізмів у дистальний відділ кишечника, виділення у просвіт кишки з її стінки імуноглобулінів; ферментативна активність; стан кишкового епітелію, слизу, виділюваної бокаловидними клітинами кишечника, містить інгібітори росту мікроорганізмів. При порушенні зазначених механізмів наростає мікробне обсіменіння тонкої кишки.
У товстій кишці у здорової людини кількість мікроорганізмів становить 1011 - 1012 КУО/г фекалій. Переважають анаеробні види бактерій (90-95% усього складу): біфідобактерії, бактероїди, лактобактерії, вейлонеллы, пептострептококи, клостридії.
Близько 5-10% мікрофлори товстого кишечника представлена аеробами: кишковою паличкою, лактозонегативными ентеробактеріями (протей, энтеробактер, цитробактер, серрации та ін), ентерококами (фекальні стрептококи), стафілококами, дріжджоподібними грибами.
